RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 CYP26B1Q9NR63 512 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 DZANK1Q9NVP4 752 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 PCDHA12Q9UN75 941 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 GAS2O43903 313 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 CXCL14O95715 111 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 ASGR2P07307 311 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 BCAR1P56945 870 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 DRP2Q13474 957 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 GIT2Q14161 759 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 RABEP1Q15276 862 aa12.87□□□□□ -0.35
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CS-221ENST00000550734 ATAT1Q5SQI0 421 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 ERMP1Q7Z2K6 904 aa12.87□□□□□ -0.35
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CS-221ENST00000550734 CCDC83Q8IWF9 413 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 SLC22A17Q8WUG5 538 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 ZBP1Q9H171 429 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 CHST12Q9NRB3 414 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 LIMD1Q9UGP4 676 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 DMXL1Q9Y485 3027 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 CARNS1A5YM72 827 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 TMEM150BA6NC51 233 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 WNT7AO00755 349 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 MARCH6O60337 910 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 NEMFO60524 1076 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 SLITRK3O94933 977 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 WEE2P0C1S8 567 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 CTSAP10619 480 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 YWHABP31946 246 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 RFC5P40937 340 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 CALCRLQ16602 461 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 OTUD6AQ7L8S5 288 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 FRMD5Q7Z6J6 570 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 VPS52Q8N1B4 723 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 HELQQ8TDG4 1101 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 C8orf76Q96K31 380 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 LXNQ9BS40 222 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 DACT1Q9NYF0 836 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 FRYLO94915 3013 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 EPCAMP16422 314 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 NPR3P17342 541 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 AOC1P19801 751 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 TRAPPC10P48553 1259 aa12.85□□□□□ -0.35
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CS-221ENST00000550734 NCAPH2Q6IBW4 605 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 KANK3Q6NY19 840 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 RNF169Q8NCN4 708 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 SLC7A3Q8WY07 619 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 TMEM169Q96HH4 297 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 MFSD1Q9H3U5 465 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 RGL1Q9NZL6 768 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 A0A087WZ62 844 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 ASAP2O43150 1006 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 PHKA2P46019 1235 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 PLA2G4FQ68DD2 849 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 GPR149Q86SP6 731 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 NOSTRINQ8IVI9 506 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 NLRP7Q8WX94 980 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 IGSF21Q96ID5 467 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 DYDC2Q96IM9 177 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 CEP170P1Q96L14 293 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 SH2D3AQ9BRG2 576 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 TMEM60Q9H2L4 133 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 IFT122Q9HBG6 1241 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 ANKEF1Q9NU02 776 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 C2orf16Q68DN1 1984 aa12.83□□□□□ -0.35
CS-221ENST00000550734 PI15O43692 258 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 ZNF623O75123 536 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 GALTP07902 379 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 FGFR4P22455 802 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP12.83□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 TXKP42681 527 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 ID4P47928 161 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 POU5F1BQ06416 359 aa12.83□□□□□ -0.36
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