RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 MTRQ99707 1265 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 STK17AQ9UEE5 414 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 NR2E1Q9Y466 385 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 CACNA1BQ00975 2339 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 PP2D1A8MPX8 630 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 STAG3L1P0CL83 205 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 CDC25AP30304 524 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 NEDD9Q14511 834 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNB1Q14721 858 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 Q4G0T1 1027 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM50Q86XT4 487 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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CTDSP2-204ENST00000548823 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 HAS1Q92839 578 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 PLCG1P19174 1290 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 AMPD3Q01432 767 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNC3Q14003 757 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 GNPTABQ3T906 1256 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 STK24Q9Y6E0 443 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.08■■□□□ 1.12
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CTDSP2-204ENST00000548823 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 CLCN1P35523 988 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 CLCN5P51795 746 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 CUL4BQ13620 913 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 HYIQ5T013 277 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM20AQ96MK3 541 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 SQORQ9Y6N5 450 aa22.07■■□□□ 1.12
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CTDSP2-204ENST00000548823 POLR2MP0CAP2 368 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 CD52P31358 61 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 KRT79Q5XKE5 535 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 AAASQ9NRG9 546 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 CBFA2T2O43439 604 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 STAM2O75886 525 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 ERVFC1P60507 584 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.125e-6■■□□□ 11.7
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF292O60281 2723 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 FSCN2O14926 492 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 MARCH6O60337 910 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 RHOBTB3O94955 611 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 FANCCQ00597 558 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 STAMQ92783 540 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 RMDN1Q96DB5 314 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 PNMA5Q96PV4 448 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 DMXL1Q9Y485 3027 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 KLRC4O43908 158 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 FGF18O76093 207 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF18P17022 549 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 CASP1P29466 404 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP1R2P41236 205 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 GATMP50440 423 aa22.03■■□□□ 1.12
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