RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548391.1

PRAMENP-203, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,445 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-203ENST00000548391 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 NFKBIZQ9BYH8 718 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 C19orf67A6NJJ6 358 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 HIDE1A8MVS5 230 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 PI4K2BG5E9Z4 385 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 USO1O60763 962 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 ERLIN2O94905 339 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 GALTP07902 379 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 NCLP19338 710 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 AXLP30530 894 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 RBM10P98175 930 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 KCNC3Q14003 757 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 AMHR2Q16671 573 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 NOTUMQ6P988 496 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 POTEGQ6S5H5 508 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 TMX3Q96JJ7 454 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 RSAD1Q9HA92 442 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 GPRC5CQ9NQ84 441 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 FSD2A1L4K1 749 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 B4GALT3O60512 393 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 ECM1Q16610 540 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 MAEAQ7L5Y9 396 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 TMC7Q7Z402 723 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF280BQ86YH2 543 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 MCPH1Q8NEM0 835 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC51Q96ER9 411 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 TMEM169Q96HH4 297 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 IGSF21Q96ID5 467 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 CPB2Q96IY4 423 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 DNAJB4Q9UDY4 337 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 IPPQ9Y573 584 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 CARNS1A5YM72 827 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 DDHD2O94830 711 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 MUTP22033 750 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 PTGDRQ13258 359 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 PDIA5Q14554 519 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 HAUS3Q68CZ6 603 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 VPS52Q8N1B4 723 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 CNNM3Q8NE01 707 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 URGCPQ8TCY9 931 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 GBP3Q9H0R5 595 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 CSRNP2Q9H175 543 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 UBN1Q9NPG3 1134 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 KANSL3Q9P2N6 904 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 KIF3AQ9Y496 699 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 C2orf71A6NGG8 1288 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 B4GALT5O43286 388 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 ITGA4P13612 1032 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 CYP11B2P19099 503 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 SLC11A1P49279 550 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 PADI6Q6TGC4 694 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 IGSF22Q8N9C0 903 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 ZBP1Q9H171 429 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 RNF39Q9H2S5 420 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 C11orf16Q9NQ32 467 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 LRWD1Q9UFC0 647 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 HES2Q9Y543 173 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 A0A1B0GUA9 196 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 ARHGEF35A5YM69 484 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 LRRIQ4A6NIV6 560 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 LAD1O00515 517 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 INPPL1O15357 1258 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 POMCP01189 267 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 COL9A1P20849 921 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 GJB2P29033 226 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 IL17AQ16552 155 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 BSNDQ8WZ55 320 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 SUSD6Q92537 303 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 GAD1Q99259 594 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms