RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 DHX58Q96C10 678 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 IFT74Q96LB3 600 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 DRC1Q96MC2 740 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 MTMR10Q9NXD2 777 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 STK17AQ9UEE5 414 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 INSL6Q9Y581 213 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 A0A0U1RQF3 1178 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 MYMKA6NI61 221 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 TBKBP1A7MCY6 615 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 RFXAPO00287 272 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 LINC00271P0C7V0 271 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 STAG3L1P0CL83 205 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 PLS3P13797 630 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 FAM189BP81408 668 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 PPP2R5AQ15172 486 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 MYLIPQ8WY64 445 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 TIPINQ9BVW5 301 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 FZD8Q9H461 694 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 CHST12Q9NRB3 414 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 DACT1Q9NYF0 836 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 KCND2Q9NZV8 630 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 ODF2LQ9ULJ1 636 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 A0A1B0GVL5 298 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 FAM13AO94988 1023 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 NPTXRO95502 500 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 PFKFB1P16118 471 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 CASP1P29466 404 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 AXLP30530 894 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 ZNF131P52739 623 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 NCKAP1LP55160 1127 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 MAPK6Q16659 721 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 FAM187BQ17R55 369 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 NOTUMQ6P988 496 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 SV2BQ7L1I2 683 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 FIBCD1Q8N539 461 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 HELQQ8TDG4 1101 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 DDX12PQ92771 950 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 CASD1Q96PB1 797 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 FIZ1Q96SL8 496 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 HES2Q9Y543 173 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 VWA8A3KMH1 1905 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 PLXNA3P51805 1871 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 K7ENM7 598 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 ACKR2O00590 384 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 NMT1P30419 496 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 RAB27AP51159 221 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 ERVK-21P61565 698 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 ADGRE1Q14246 886 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.896e-13■□□□□ 9.5
CS-211ENST00000548041 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 ADALQ6DHV7 355 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 SFR1Q86XK3 245 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-211ENST00000548041 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms