RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
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CLSTN3-215ENST00000544584 ADAMTS3O15072 1205 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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CLSTN3-215ENST00000544584 ITGA4P13612 1032 aa6.2□□□□□ -1.42
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CLSTN3-215ENST00000544584 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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CLSTN3-215ENST00000544584 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
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