RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 PLA2G6O60733 806 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 RPS6KA3P51812 740 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 OCA2Q04671 838 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC63Q05C16 580 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 NELFBQ8WX92 580 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 RILPQ96NA2 401 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINI1Q99574 410 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 S100A1P23297 94 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 TSC22D1Q15714 1073 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 SRGAP2O75044 1071 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 TRIM50Q86XT4 487 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 AMNQ9BXJ7 453 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 CYP3A7P24462 503 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 USP17L5A8MUK1 530 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 FAM160B2Q86V87 743 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 TBCKQ8TEA7 893 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 COG1Q8WTW3 980 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SHISA4Q96DD7 197 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 PSME4Q14997 1843 aa6.46□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 FAM205CA6NFA0 338 aa6.46□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 CDK17Q00537 523 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ASPHQ12797 758 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 FAM182BQ5T319 152 aa6.46□□□□□ -1.37
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