RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 AGMOQ6ZNB7 445 aa28.32■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 PRIMPOLQ96LW4 560 aa28.32■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 ASB2Q96Q27 587 aa28.32■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 RUSC1Q9BVN2 902 aa28.32■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa28.32■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 SLC26A4O43511 780 aa28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 OFD1O75665 1012 aa28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 NCLP19338 710 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
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TCEA1-202ENST00000517351 UBE3AQ05086 875 aa28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 GRIN1Q05586 938 aa28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 PTPAQ15257 358 aa28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 TMEM119Q4V9L6 283 aa28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 NOMO2Q5JPE7 1267 aa28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 FZD8Q9H461 694 aa28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 RSAD1Q9HA92 442 aa28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 IPPQ9Y573 584 aa28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 TRANK1O15050 2925 aa28.31■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa28.3■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 PBX3P40426 434 aa28.3■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 MAPK6Q16659 721 aa28.3■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 FAM187BQ17R55 369 aa28.3■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 AAK1Q2M2I8 961 aa28.3■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 C1orf186Q6ZWK4 172 aa28.3■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 CALML4Q96GE6 196 aa28.3■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 TBC1D13Q9NVG8 400 aa28.3■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 A0A1B0GUA9 196 aa28.29■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 HIP1RO75146 1068 aa28.29■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 ITGA4P13612 1032 aa28.29■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 LIG1P18858 919 aa28.29■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 PPM1AP35813 382 aa28.29■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 URGCPQ8TCY9 931 aa28.29■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 KIFC3Q9BVG8 833 aa28.29■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 MYO7AQ13402 2215 aa28.28■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 DLL1O00548 723 aa28.28■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 PRKCBP05771 671 aa28.28■■■□□ 2.12
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TCEA1-202ENST00000517351 PLCB3Q01970 1234 aa28.28■■■□□ 2.12
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TCEA1-202ENST00000517351 TMEM132AQ24JP5 1023 aa28.28■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 SLC27A1Q6PCB7 646 aa28.28■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 DAW1Q8N136 415 aa28.28■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 DRC1Q96MC2 740 aa28.28■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC113Q9H0I3 377 aa28.28■■■□□ 2.12
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TCEA1-202ENST00000517351 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
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TCEA1-202ENST00000517351 RASSF8Q8NHQ8 419 aa28.27■■■□□ 2.12
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TCEA1-202ENST00000517351 USP28Q96RU2 1077 aa28.27■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 TIPINQ9BVW5 301 aa28.27■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 APOL6Q9BWW8 343 aa28.27■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa28.27■■■□□ 2.12
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TCEA1-202ENST00000517351 TLR9Q9NR96 1032 aa28.27■■■□□ 2.12
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TCEA1-202ENST00000517351 SLC12A3P55017 1021 aa28.26■■■□□ 2.11
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TCEA1-202ENST00000517351 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
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TCEA1-202ENST00000517351 PPP2R3CQ969Q6 453 aa28.26■■■□□ 2.11
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TCEA1-202ENST00000517351 RNF39Q9H2S5 420 aa28.26■■■□□ 2.11
TCEA1-202ENST00000517351 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
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TCEA1-202ENST00000517351 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TCEA1-202ENST00000517351 LZTS1Q9Y250 596 aa28.26■■■□□ 2.11
TCEA1-202ENST00000517351 TTLL13PA6NNM8 815 aa28.25■■■□□ 2.11
TCEA1-202ENST00000517351 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa28.25■■■□□ 2.11
TCEA1-202ENST00000517351 ACKR2O00590 384 aa28.25■■■□□ 2.11
TCEA1-202ENST00000517351 N4BP3O15049 544 aa28.25■■■□□ 2.11
TCEA1-202ENST00000517351 NPTX2P47972 431 aa28.25■■■□□ 2.11
TCEA1-202ENST00000517351 KCNQ1P51787 676 aa28.25■■■□□ 2.11
TCEA1-202ENST00000517351 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
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