RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 TIAM1Q13009 1591 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ACRV1P26436 265 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 MENTQ9BUN1 341 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 CABP5Q9NP86 173 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 SLIT1O75093 1534 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 NWD1Q149M9 1564 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 JMJD7P0C870 316 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 RIN1Q13671 783 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 MYBPC3Q14896 1274 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 TTC38Q5R3I4 469 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 BRINP3Q76B58 766 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 DRC1Q96MC2 740 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 GPHA2Q96T91 129 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 PIF1Q9H611 641 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 SHPRHQ149N8 1683 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 LRP5O75197 1615 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 H7C1D1 291 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ASMTLO95671 621 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 TSPY4P0CV99 314 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 TSPY10P0CW01 314 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 FHL2Q14192 279 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ACAP1Q15027 740 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 DGKDQ16760 1214 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 NME9Q86XW9 330 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 KIF18BQ86Y91 864 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 UBXN4Q92575 508 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 TLR9Q9NR96 1032 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 EEA1Q15075 1411 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 OVOL3O00110 214 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 SLC9A1P19634 815 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 STAT3P40763 770 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 TGFB2P61812 414 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 DGCR2P98153 550 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 CLEC14AQ86T13 490 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 MTFR1LQ9H019 292 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 C1SP09871 688 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 PTH1RQ03431 593 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF174Q15697 407 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 CFAP100Q494V2 611 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 OXSMQ9NWU1 459 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 CEP72Q9P209 647 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-217ENST00000509355 A0A0A6YYJ9 748 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms