RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495087.5

RAD18-210, Transcript of RAD18, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 4

Gene RAD18, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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