RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494398.5

CERKL-213, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2

Gene CERKL, Length 2,391 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-213ENST00000494398 CCNE2O96020 404 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 EGFRP00533 1210 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 MXI1P50539 228 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 KRT76Q01546 638 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PIK3R5Q8WYR1 880 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 GINM1Q9NU53 330 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PNMA2Q9UL42 364 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 GOLGA8IPA6NC78 632 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 GOLGA8JA6NMD2 632 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 IRAK1P51617 712 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 SMTNP53814 917 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 NCKAP1LP55160 1127 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 KCTD16Q68DU8 428 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 RHOT2Q8IXI1 618 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PLEKHO2Q8TD55 490 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 PPFIA4O75335 1185 aa23.07■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 PIM2Q9P1W9 311 aa23.07■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 RSPH14Q9UHP6 348 aa23.07■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 COG5Q9UP83 839 aa23.07■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 ECHS1P30084 290 aa23.07■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 CD302Q8IX05 232 aa23.07■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 TBX20Q9UMR3 447 aa23.07■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 VWA5AO00534 786 aa23.06■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 CARD9Q9H257 536 aa23.06■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.06■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.06■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 SH2D3CQ8N5H7 860 aa23.06■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.06■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.06■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 TTI1O43156 1089 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 ADRB2P07550 413 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 SKIDA1Q1XH10 827 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 DCAF12L1Q5VU92 463 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 NLRX1Q86UT6 975 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 KAT5Q92993 513 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 LRRC45Q96CN5 670 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 ATG4CQ96DT6 458 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 PLAAQ9Y263 795 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 TULP2O00295 520 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 PMM2O15305 246 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 CNGA1P29973 690 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 ADSSP30520 456 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 NPTX2P47972 431 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 GNGT1P63211 74 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 NAA35Q5VZE5 725 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 ANO5Q75V66 913 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 PPM1KQ8N3J5 372 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 SAAL1Q96ER3 474 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 RNF146Q9NTX7 359 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 ALG6Q9Y672 507 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 ANKRD63C9JTQ0 380 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 DAPK3O43293 454 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 FDX1P10109 184 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 GPC5P78333 572 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 RIPK3Q9Y572 518 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 SGPL1O95470 568 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 SRLQ86TD4 932 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 WNK4Q96J92 1243 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 DENND3A2RUS2 1198 aa23.03■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 A6NNZ2 444 aa23.03■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 RTN2O75298 545 aa23.03■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 CCND2P30279 289 aa23.03■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 HADHBP55084 474 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 SKOR1P84550 965 aa23.03■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 TUBB8Q3ZCM7 444 aa23.03■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CERKL-213ENST00000494398 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms