RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 CETN3O15182 167 aa24.15■■□□□ 1.46
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PSPC1-204ENST00000492741 NR3C1P04150 777 aa24.15■■□□□ 1.46
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PSPC1-204ENST00000492741 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.15■■□□□ 1.46
PSPC1-204ENST00000492741 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.15■■□□□ 1.46
PSPC1-204ENST00000492741 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.15■■□□□ 1.46
PSPC1-204ENST00000492741 THAP9Q9H5L6 903 aa24.15■■□□□ 1.46
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PSPC1-204ENST00000492741 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.15■■□□□ 1.46
PSPC1-204ENST00000492741 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.15■■□□□ 1.46
PSPC1-204ENST00000492741 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.15■■□□□ 1.46
PSPC1-204ENST00000492741 KCNN1Q92952 543 aa24.15■■□□□ 1.46
PSPC1-204ENST00000492741 OSMRQ99650 979 aa24.15■■□□□ 1.46
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PSPC1-204ENST00000492741 USP20Q9Y2K6 914 aa24.15■■□□□ 1.46
PSPC1-204ENST00000492741 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.453e-6■■□□□ 12.9
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PSPC1-204ENST00000492741 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.14■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 TISP43B9A030 160 aa24.13■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 B4GALT4O60513 344 aa24.13■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 FZD8Q9H461 694 aa24.13■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.13■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.13■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 ERLIN2O94905 339 aa24.13■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 SERPINC1P01008 464 aa24.13■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 CDKAL1Q5VV42 579 aa24.13■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.13■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 WNT8BQ93098 351 aa24.13■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 KCNJ18B7U540 433 aa24.12■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 ZNF18P17022 549 aa24.12■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 KCNJ12Q14500 433 aa24.12■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.12■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 TCHPQ9BT92 498 aa24.12■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.12■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.12■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 EXOC3O60645 756 aa24.11■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 NFIL3Q16649 462 aa24.11■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.11■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 GNA14O95837 355 aa24.1■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 PIGRP01833 764 aa24.1■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.1■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 ZPBP2Q6X784 338 aa24.1■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.1■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.1■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.1■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 EDN1P05305 212 aa24.1■■□□□ 1.45
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PSPC1-204ENST00000492741 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 FANCCQ00597 558 aa24.1■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 MYBPC2Q14324 1141 aa24.1■■□□□ 1.45
PSPC1-204ENST00000492741 SNX17Q15036 470 aa24.1■■□□□ 1.45
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