RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
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TOM1-216ENST00000492723 MXI1P50539 228 aa18.17■□□□□ 0.5
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TOM1-216ENST00000492723 SLC39A4Q6P5W5 647 aa18.17■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
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TOM1-216ENST00000492723 LY6KQ17RY6 165 aa18.14■□□□□ 0.49
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TOM1-216ENST00000492723 TGFB3P10600 412 aa18.13■□□□□ 0.49
TOM1-216ENST00000492723 MEI1Q5TIA1 1274 aa18.13■□□□□ 0.49
TOM1-216ENST00000492723 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TOM1-216ENST00000492723 FBXL18Q96ME1 805 aa18.13■□□□□ 0.49
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TOM1-216ENST00000492723 PMM2O15305 246 aa18.12■□□□□ 0.49
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TOM1-216ENST00000492723 SASH3O75995 380 aa18.12■□□□□ 0.49
TOM1-216ENST00000492723 TNFAIP3P21580 790 aa18.12■□□□□ 0.49
TOM1-216ENST00000492723 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TOM1-216ENST00000492723 PAFAH1B1P43034 410 aa18.12■□□□□ 0.49
TOM1-216ENST00000492723 LIG4P49917 911 aa18.12■□□□□ 0.49
TOM1-216ENST00000492723 STAT5BP51692 787 aa18.12■□□□□ 0.49
TOM1-216ENST00000492723 CYP24A1Q07973 514 aa18.12■□□□□ 0.49
TOM1-216ENST00000492723 KCTD2Q14681 263 aa18.12■□□□□ 0.49
TOM1-216ENST00000492723 KIF22Q14807 665 aa18.12■□□□□ 0.49
TOM1-216ENST00000492723 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
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