RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491163.1

C7orf50-208, Transcript of chromosome 7 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene C7orf50, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf50-208ENST00000491163 HES2Q9Y543 173 aa22.13■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.13■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 HOXA2O43364 376 aa22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 EOMESO95936 686 aa22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 RAB27AP51159 221 aa22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PEX3P56589 373 aa22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 SLC39A14Q15043 492 aa22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 NOTUMQ6P988 496 aa22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 IFT74Q96LB3 600 aa22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.12■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 MYH11P35749 1972 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 CCDC169A6NNP5 214 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 ITGB1P05556 798 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PRKCBP05771 671 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 MCM6Q14566 821 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 STK38Q15208 465 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 LRRC43Q8N309 656 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 APOL6Q9BWW8 343 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 RNF39Q9H2S5 420 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 IPPQ9Y573 584 aa22.11■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 ZNF623O75123 536 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 NPTXRO95502 500 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 RB1P06400 928 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 SKIP12755 728 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 DNAJB1P25685 340 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 NPTX2P47972 431 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PPP2R5AQ15172 486 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 40.2
C7orf50-208ENST00000491163 ARSHQ5FYA8 562 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 GPBP1Q86WP2 473 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 RAD54LQ92698 747 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PLVAPQ9BX97 442 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 FZD8Q9H461 694 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.1■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 GUCY2CP25092 1073 aa22.09■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 AXLP30530 894 aa22.09■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 MAPK6Q16659 721 aa22.09■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.09■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.09■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.135e-8■■■■□ 26.2
C7orf50-208ENST00000491163 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 DRC1Q96MC2 740 aa22.09■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.09■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 SPTLC2O15270 562 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 SLC26A4O43511 780 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 B4GALT3O60512 393 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 OFD1O75665 1012 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 CAMK1Q14012 370 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PTPROQ16827 1216 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PGBD4Q96DM1 585 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 CCDC51Q96ER9 411 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 REEP2Q9BRK0 252 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 GBP3Q9H0R5 595 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 RSAD1Q9HA92 442 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.08■■□□□ 1.13
C7orf50-208ENST00000491163 A0A087X0B3 334 aa22.07■■□□□ 1.12
C7orf50-208ENST00000491163 A0A1B0GUA9 196 aa22.07■■□□□ 1.12
C7orf50-208ENST00000491163 SLC16A4O15374 487 aa22.07■■□□□ 1.12
C7orf50-208ENST00000491163 ITGA4P13612 1032 aa22.07■■□□□ 1.12
C7orf50-208ENST00000491163 LAG3P18627 525 aa22.07■■□□□ 1.12
C7orf50-208ENST00000491163 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
C7orf50-208ENST00000491163 FAM187BQ17R55 369 aa22.07■■□□□ 1.12
C7orf50-208ENST00000491163 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.07■■□□□ 1.12
C7orf50-208ENST00000491163 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.07■■□□□ 1.12
C7orf50-208ENST00000491163 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.07■■□□□ 1.12
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