RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 TIPINQ9BVW5 301 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GUA9 196 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 NPTX2P47972 431 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 ABI1Q8IZP0 508 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 RAD54LQ92698 747 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 P2RX5Q93086 422 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 DRC1Q96MC2 740 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 KCND2Q9NZV8 630 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 SFI1A8K8P3 1242 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 SPTLC2O15270 562 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 GRM6O15303 877 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 OFD1O75665 1012 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 BRD1O95696 1058 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 EDN1P05305 212 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 PEX3P56589 373 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 MCM6Q14566 821 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 MAPK6Q16659 721 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 LRRC43Q8N309 656 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 PGBD4Q96DM1 585 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 IPPQ9Y573 584 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 ACKR2O00590 384 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 PPP6R2O75170 966 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 YEATS4O95619 227 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 PRKCBP05771 671 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 DDIT3P35638 169 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 EFNA5P52803 228 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 CNNM3Q8NE01 707 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 RNF39Q9H2S5 420 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 USP20Q9Y2K6 914 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 CCDC169A6NNP5 214 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 ITGB1P05556 798 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 LIG1P18858 919 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 BECN1Q14457 450 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 PTPROQ16827 1216 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 SLC27A1Q6PCB7 646 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 GPBP1Q86WP2 473 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 AAASQ9NRG9 546 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 NPTXRO95502 500 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 PLS3P13797 630 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 LAG3P18627 525 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 ATL3Q6DD88 541 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 PDZD7Q9H5P4 517 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 RSAD1Q9HA92 442 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 HES2Q9Y543 173 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 K7ERI5 159 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 ITGA4P13612 1032 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 DNAJB1P25685 340 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 TXLNAP40222 546 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 CAMK1Q14012 370 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 REEP2Q9BRK0 252 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.09■■□□□ 1.29
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