RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 IQCF3P0C7M6 154 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 ADSSP30520 456 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 TMEM62Q0P6H9 643 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 STRN3Q13033 797 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 PTGISQ16647 500 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 AMHR2Q16671 573 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 FAM187BQ17R55 369 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 KIZQ2M2Z5 673 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 RPAINQ86UA6 219 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 NME8Q8N427 588 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 NLRP7Q8WX94 980 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 CBWD1Q9BRT8 395 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 CDHR5Q9HBB8 845 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-209ENST00000470095 KCNJ18B7U540 433 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 ACKR2O00590 384 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 CDK7P50613 346 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 CDC42EP1Q00587 391 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 FANCCQ00597 558 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 ADAM9Q13443 819 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 MYBPC2Q14324 1141 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 KCNJ12Q14500 433 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 MAPK6Q16659 721 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 BICD1Q96G01 975 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 SCLT1Q96NL6 688 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 STYXL1Q9Y6J8 313 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 ABLIM1O14639 778 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 CETN3O15182 167 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 B4GALT5O43286 388 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 B4GALT4O60513 344 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 DARSP14868 501 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 RPL13P26373 211 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 GJA8P48165 433 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 CASP4P49662 377 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 LIG4P49917 911 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 CYP2J2P51589 502 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 MARSP56192 900 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 SPAG1Q07617 926 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 MGAT3Q09327 533 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 PTK7Q13308 1070 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 SNX17Q15036 470 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 KRT31Q15323 416 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 ARMCX5Q6P1M9 558 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 ZPBP2Q6X784 338 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 TMEM40Q8WWA1 233 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 OSMRQ99650 979 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 MCOLN1Q9GZU1 580 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 HAPLN2Q9GZV7 340 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 AKAP3O75969 853 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 TFRCP02786 760 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 GARTP22102 1010 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 PROZP22891 400 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 ZNF75DP51815 510 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 PLCB2Q00722 1185 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 RSPH3Q86UC2 560 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 BORCS6Q96GS4 357 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 MKNK1Q9BUB5 465 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 PCIF1Q9H4Z3 704 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 INTS13Q9NVM9 706 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 TAB2Q9NYJ8 693 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 HSPBP1Q9NZL4 362 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 GINS2Q9Y248 185 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 TRPV2Q9Y5S1 764 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-209ENST00000470095 CDY2AQ9Y6F7 541 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms