RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467024.5

IFT52-205, Transcript of intraflagellar transport 52, human

TSL 2

Gene IFT52, Length 515 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT52-205	ENST00000467024	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		3.82	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		3.82	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	AKT3	Q9Y243	479 aa		3.82	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	UST	Q9Y2C2	406 aa		3.82	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	SAMM50	Q9Y512	469 aa		3.82	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	WDR64	B1ANS9	1081 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	MSTN	O14793	375 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	MSH4	O15457	936 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	HOXA2	O43364	376 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	ZNF862	O60290	1169 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	STBD1	O95210	358 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CXCL14	O95715	111 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	OAT	P04181	439 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CPA1	P15085	419 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	AVPR2	P30518	371 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	SFN	P31947	248 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	PPM1A	P35813	382 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	PBX3	P40426	434 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	GPC3	P51654	580 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CLCN3	P51790	818 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	BCAR1	P56945	870 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	FGD1	P98174	961 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CDC42EP1	Q00587	391 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	ITIH3	Q06033	890 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	NTRK3	Q16288	839 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	PTPN21	Q16825	1174 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CES5A	Q6NT32	575 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024		Q6ZUG5	572 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	TMC7	Q7Z402	723 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	ABI1	Q8IZP0	508 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	BICD2	Q8TD16	824 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	SLC5A5	Q92911	643 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	KCNB2	Q92953	911 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	PHKB	Q93100	1093 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	ASIC4	Q96FT7	647 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	FAM167A	Q96KS9	214 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	ZNF558	Q96NG5	402 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	MAP7D2	Q96T17	732 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	RIT2	Q99578	217 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	APOL5	Q9BWW9	433 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CHST12	Q9NRB3	414 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	DISC1	Q9NRI5	854 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	DACT1	Q9NYF0	836 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	NID2	Q14112	1375 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024		A0A087WZ62	844 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	GAS7	O60861	476 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	ZNF623	O75123	536 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	PSMD10	O75832	226 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	GALT	P07902	379 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	SKI	P12755	728 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	IFNAR1	P17181	557 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	FGFR4	P22455	802 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	CYP3A7	P24462	503 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	HSPA4	P34932	840 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	MTHFR	P42898	656 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	PHKA2	P46019	1235 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	DNM2	P50570	870 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	JAK3	P52333	1124 aa		3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
IFT52-205	ENST00000467024	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms