RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448828.5

NME4-206, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,167 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-206ENST00000448828 ARL2P36404 184 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 MBTD1Q05BQ5 628 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 MUC3AQ02505 3323 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 FSD2A1L4K1 749 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 HIDE1A8MVS5 230 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 H3BQV1 296 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 AXLP30530 894 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.622e-46■■■■□ 22.3
NME4-206ENST00000448828 DUSP6Q16828 381 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 UBXN11Q5T124 520 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 AGMOQ6ZNB7 445 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 APOL6Q9BWW8 343 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 EPHX3Q9H6B9 360 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 CLEC1BQ9P126 229 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 ITGA4P13612 1032 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 GJB2P29033 226 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 TMEM132AQ24JP5 1023 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 RAB34Q9BZG1 259 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 DNAJB4Q9UDY4 337 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 IPPQ9Y573 584 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 POMCP01189 267 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.624e-6■■■■□ 23.1
NME4-206ENST00000448828 ZP2Q05996 745 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 PTGDRQ13258 359 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 PADI6Q6TGC4 694 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 ADHFE1Q8IWW8 467 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 CNNM3Q8NE01 707 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 CCDC51Q96ER9 411 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 MSLNLQ96KJ4 702 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 CARNS1A5YM72 827 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 B4GALT5O43286 388 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 LIG1P18858 919 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 MCM2P49736 904 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 POU5F1BQ06416 359 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 HACE1Q8IYU2 909 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 VPS52Q8N1B4 723 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 SMRP1Q8NCR6 262 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 VN1R2Q8NFZ6 395 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 CSRNP2Q9H175 543 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 HES2Q9Y543 173 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 GALTP07902 379 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 MLH1P40692 756 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 SLC11A1P49279 550 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 COASYQ13057 564 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 ZNF280BQ86YH2 543 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 IGSF21Q96ID5 467 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 NFKBIZQ9BYH8 718 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 UBN1Q9NPG3 1134 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 KANSL3Q9P2N6 904 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 NPTXRO95502 500 aa25.14■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 AMHR2Q16671 573 aa25.14■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 AUTS2Q8WXX7 1259 aa25.14■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 APOL5Q9BWW9 433 aa25.14■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
NME4-206ENST00000448828 LAD1O00515 517 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 B4GALT3O60512 393 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 EYA4O95677 639 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-206ENST00000448828 MUTP22033 750 aa25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms