RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443509.6

PRUNE2-208, Transcript of prune homolog 2, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PRUNE2, Length 12,356 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRUNE2-208	ENST00000443509	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ASNS	P08243	561 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CHRNA3	P32297	505 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CCNA1	P78396	465 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PSMD14	O00487	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	GYG2	O15488	501 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	S100A5	P33763	92 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ADAM9	Q13443	819 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CYTH2	Q99418	400 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NR2F2	P24468	414 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SLC1A1	P43005	524 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TULP2	O00295	520 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ENPEP	Q07075	957 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CDKL2	Q92772	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	KRIT1	O00522	736 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MTTP	P55157	894 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PHLPP1	O60346	1717 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PPP1R37	O75864	691 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NPEPPS	P55786	919 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FMO2	Q99518	471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	GREM2	Q9H772	168 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	GNB5	O14775	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	DSE	Q9UL01	958 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	IPP	Q9Y573	584 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	POTEF	A5A3E0	1075 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TOMM70	O94826	608 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RAD23B	P54727	409 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	KLHL12	Q53G59	568 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MTMR7	Q9Y216	660 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	EPS8	Q12929	822 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TBCC	Q15814	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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