RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 ZNF410Q86VK4 478 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 EXOC8Q8IYI6 725 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 STAMQ92783 540 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 IGSF21Q96ID5 467 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 C8orf76Q96K31 380 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 TEKT3Q9BXF9 490 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 SEMA4AQ9H3S1 761 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 IGSF9Q9P2J2 1179 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 LIMD1Q9UGP4 676 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 FBXL21Q9UKT6 434 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 DCHS1Q96JQ0 3298 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 VPS13AQ96RL7 3174 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 FAM205CA6NFA0 338 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 ASGR2P07307 311 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 WEE2P0C1S8 567 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 AOC1P19801 751 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 TDGQ13569 410 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 NOMO2Q5JPE7 1267 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 CYP26C1Q6V0L0 522 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 FLCNQ8NFG4 579 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 LENG9Q96B70 501 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 KANSL3Q9P2N6 904 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 BTBD18B2RXH4 712 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 SLC37A4O43826 429 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 ZNF623O75123 536 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 ATP2B1P20020 1258 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 Q4G0T1 1027 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 XKR3Q5GH77 459 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 KANK3Q6NY19 840 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 FRMD5Q7Z6J6 570 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 GPR149Q86SP6 731 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 FEZF2Q8TBJ5 459 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 FAM105AQ9NUU6 356 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D13Q9NVG8 400 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 DUSP12Q9UNI6 340 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-210ENST00000442481 EDIL3O43854 480 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 GALTP07902 379 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 EPCAMP16422 314 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 KLRC2P26717 231 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 ID4P47928 161 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CATSPER4Q7RTX7 472 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 MIER3Q7Z3K6 550 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CCDC105Q8IYK2 499 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A17Q8WUG5 538 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 SLC5A5Q92911 643 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 NXPE3Q969Y0 559 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 TMX3Q96JJ7 454 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 TMEM175Q9BSA9 504 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 UNC45AQ9H3U1 944 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 UBN1Q9NPG3 1134 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 PPME1Q9Y570 386 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 WDR81Q562E7 1941 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 ZNF862O60290 1169 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 NR1I2O75469 434 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 ALDH2P05091 517 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 URODP06132 367 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 ADH1AP07327 375 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CYP3A7P24462 503 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 PTPN14Q15678 1187 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 MTERF2Q49AM1 385 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 MOXD1Q6UVY6 613 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 POTEDQ86YR6 584 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 RHPN2Q8IUC4 686 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 ADSSL1Q8N142 457 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CNNM3Q8NE01 707 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 GBP3Q9H0R5 595 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms