RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF510Q9Y2H8 683 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 BICDL2A1A5D9 508 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PFDN1O60925 122 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOBTB3O94955 611 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 FCER1AP12319 257 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ETS2P15036 469 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNA2P16389 499 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 USP46P62068 366 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 DEUP1Q05D60 604 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 STK4Q13043 487 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 DAAM2Q86T65 1068 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL13Q8N6R0 699 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CARD9Q9H257 536 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 VCX3BQ9H321 246 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 VCX3AQ9NNX9 186 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 HAO1Q9UJM8 370 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 LRCH1Q9Y2L9 728 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SCINQ9Y6U3 715 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A087X0T9 212 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 O00370 1275 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA31D3P0C874 917 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM228BP0C875 321 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 DESP17661 470 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PLTPP55058 493 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 INHBCP55103 352 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 BPIFB4P59827 614 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC6Q16204 474 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PKN1Q16512 942 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 VSIG1Q86XK7 387 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTRT1Q8TDG2 376 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 32.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 DISC1Q9NRI5 854 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL14Q9P2G3 628 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 STK25O00506 426 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TLR2O60603 784 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 AGTP01019 485 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 NUDT17P0C025 328 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CREB1P16220 341 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 RASA1P20936 1047 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 EPHB2P29323 1055 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 MCAMP43121 646 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 USP11P51784 963 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNMA1Q12791 1236 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 GRAPQ13588 217 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SUSD4Q5VX71 490 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPRN2Q92932 1015 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 IQCDQ96DY2 449 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC188H7C350 402 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 GNA14O95837 355 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CD151P48509 253 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 Q4G0T1 1027 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 NAPBQ9H115 298 aa9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms