RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436111.1

PKN2-204, Transcript of protein kinase N2, human

TSL 3

Gene PKN2, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN2-204	ENST00000436111	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	PLD2	O14939	933 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	TRIM24	O15164	1050 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	RFPL3	O75679	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	STC2	O76061	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	NPTXR	O95502	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	GYPE	P15421	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	KCNA6	P17658	529 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	USP14	P54578	494 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111		Q6YL49	198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	SCLY	Q96I15	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKN2-204	ENST00000436111	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	PDE8A	O60658	829 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	KRT37	O76014	449 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	CDK4	P11802	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	CPE	P16870	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	MTSS1	O43312	755 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	LPXN	O60711	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	KIF11	P52732	1056 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	BCAR1	P56945	870 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	UBR7	Q8N806	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	DVL2	O14641	736 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PKN2-204	ENST00000436111	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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