RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NPTX2P47972 431 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMTNP53814 917 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GJA9P57773 515 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KCNH2Q12809 1159 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EMC2Q15006 297 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLCB4Q15147 1175 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPP2R5AQ15172 486 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SYCP3Q8IZU3 236 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RETREG2Q8NC44 543 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IFT74Q96LB3 600 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAJC7Q99615 494 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DESI2Q9BSY9 194 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NUP58Q9BVL2 599 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MMRN2Q9H8L6 949 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.76□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A1W2PQJ5 194 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC169A6NNP5 214 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKRD63C9JTQ0 380 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAGEB2O15479 319 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EPB41P11171 864 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RTP1P59025 263 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZBED6P86452 979 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 APBA1Q02410 837 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FIGNQ5HY92 759 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WDR59Q6PJI9 974 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NYAP1Q6ZVC0 841 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HS2ST1Q7LGA3 356 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRIM50Q86XT4 487 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM186BQ8IYM0 893 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR8K1Q8NGG5 319 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHP1Q99653 195 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CRACR2AQ9BSW2 395 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCIF1Q9H4Z3 704 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A0U1RQJ8 604 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RRN3P2A6NIE6 340 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADCY6O43306 1168 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAFO75444 373 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NOL4O94818 638 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 F2P00734 622 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AFPP02771 609 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYL3P08590 195 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF286BP0CG31 522 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GNAT1P11488 350 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNNT1P13805 278 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMOD1P28289 359 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NKX3-2P78367 333 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GNASQ5JWF2 1037 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TAS1R3Q7RTX0 852 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RNF180Q86T96 592 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC9A9Q8IVB4 645 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRPV1Q8NER1 839 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ASAP3Q8TDY4 903 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATRIPQ8WXE1 791 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPOCK2Q92563 424 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM143Q96AN5 459 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CBWD1Q9BRT8 395 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C16orf70Q9BSU1 422 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM206Q9H813 350 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KMT5AQ9NQR1 393 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TSKSQ9UJT2 592 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBX20Q9UMR3 447 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SIP14410 1827 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DENND3A2RUS2 1198 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 INHAP05111 366 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARL2P36404 184 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CAP1Q01518 475 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPFIA1Q13136 1202 aa10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTPN14Q15678 1187 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms