RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.25■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.25■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XKR3Q5GH77 459 aa20.25■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLK2Q6UY11 383 aa20.25■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.25■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM71BQ8TC56 605 aa20.25■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO41Q8TF61 875 aa20.25■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.25■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ICAM3P32942 547 aa20.24■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GYS2P54840 703 aa20.24■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FSTL1Q12841 308 aa20.24■□□□□ 0.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT39Q6A163 491 aa20.24■□□□□ 0.83
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