RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 KCTD17Q8N5Z5 321 aa27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 CWH43Q9H720 699 aa27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 LMCD1Q9NZU5 365 aa27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 USP20Q9Y2K6 914 aa27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC169A6NNP5 214 aa27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 GRM6O15303 877 aa27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PEX3P56589 373 aa27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHL23Q8NBE8 558 aa27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PGBD4Q96DM1 585 aa27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PLVAPQ9BX97 442 aa27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 CCSER1Q9C0I3 900 aa27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 FZD8Q9H461 694 aa27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 MYH15Q9Y2K3 1946 aa27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 NASPP49321 788 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 MAPK7Q13164 816 aa27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPROQ16827 1216 aa27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM132AQ24JP5 1023 aa27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 DRC1Q96MC2 740 aa27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 AAASQ9NRG9 546 aa27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PLAGL2Q9UPG8 496 aa27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 MYO7AQ13402 2215 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 TTLL13PA6NNM8 815 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PRKCBP05771 671 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 GUCY2CP25092 1073 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 NPTX2P47972 431 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 MCM6Q14566 821 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 MAPK6Q16659 721 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 GLB1LQ6UWU2 654 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 AGMOQ6ZNB7 445 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC43Q8N309 656 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 LINC00301Q8NCQ3 95 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC51Q96ER9 411 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 IPPQ9Y573 584 aa27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 OFD1O75665 1012 aa27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 NPTXRO95502 500 aa27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 ITGB1P05556 798 aa27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 ARSHQ5FYA8 562 aa27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 GPBP1Q86WP2 473 aa27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 RAD54LQ92698 747 aa27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 P2RX5Q93086 422 aa27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 APOL6Q9BWW8 343 aa27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC113Q9H0I3 377 aa27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF39Q9H2S5 420 aa27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 HES2Q9Y543 173 aa27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 REV3LO60673 3130 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1B0GUA9 196 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 SPTLC2O15270 562 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 ITGA4P13612 1032 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 NCLP19338 710 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PBX3P40426 434 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 EFNA5P52803 228 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM187BQ17R55 369 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 NOMO2Q5JPE7 1267 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 SPPL3Q8TCT6 385 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PRIMPOLQ96LW4 560 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 TIPINQ9BVW5 301 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PANK2Q9BZ23 570 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 KMT5AQ9NQR1 393 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC39Q9UFE4 941 aa27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1-202ENST00000425695 K7ERI5 159 aa27.57■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 ACKR2O00590 384 aa27.57■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 EDN1P05305 212 aa27.57■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 LAG3P18627 525 aa27.57■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 NAALADL2Q58DX5 795 aa27.57■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC27A1Q6PCB7 646 aa27.57■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 THNSL1Q8IYQ7 743 aa27.57■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 CNNM3Q8NE01 707 aa27.57■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 RSAD1Q9HA92 442 aa27.57■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 MYH11P35749 1972 aa27.57■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC16A4O15374 487 aa27.56■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAJB1P25685 340 aa27.56■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 TXLNAP40222 546 aa27.56■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 BECN1Q14457 450 aa27.56■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 RRAGBQ5VZM2 374 aa27.56■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNT2Q6UVM3 1135 aa27.56■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 GBP3Q9H0R5 595 aa27.56■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 LMAN2LQ9H0V9 348 aa27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms