RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TSPAN1O60635 241 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MUTP22033 750 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GLRA2P23416 452 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MCM2P49736 904 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CAPSQ13938 189 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NBR1Q14596 966 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DUSP6Q16828 381 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UBXN11Q5T124 520 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NOTUMQ6P988 496 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMC7Q7Z402 723 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC51Q96ER9 411 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM169Q96HH4 297 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMX3Q96JJ7 454 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RSAD1Q9HA92 442 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CLEC1BQ9P126 229 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.84□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EYA4O95677 639 aa14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GLP2RO95838 553 aa14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COASYQ13057 564 aa14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 POTEGQ6S5H5 508 aa14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 STK24Q9Y6E0 443 aa14.83□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GALTP07902 379 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ITGA4P13612 1032 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZP2Q05996 745 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PTGDRQ13258 359 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PDIA5Q14554 519 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MCTP1Q6DN14 999 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CPB2Q96IY4 423 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAB34Q9BZG1 259 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GBP3Q9H0R5 595 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CSRNP2Q9H175 543 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IPPQ9Y573 584 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.82□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HIDE1A8MVS5 230 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LAD1O00515 517 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CXCL14O95715 111 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CYP11B2P19099 503 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AMHR2Q16671 573 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PADI6Q6TGC4 694 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HACE1Q8IYU2 909 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 VPS52Q8N1B4 723 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IGSF21Q96ID5 467 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MUC3AQ02505 3323 aa14.81□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.8□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 H3BQV1 296 aa14.8□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 POMCP01189 267 aa14.8□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ALDH2P05091 517 aa14.8□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GJB2P29033 226 aa14.8□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CA8P35219 290 aa14.8□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC11A1P49279 550 aa14.8□□□□□ -0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms