RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
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PTPRJ-201ENST00000418331 TTC39CQ8N584 583 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRJ-201ENST00000418331 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRJ-201ENST00000418331 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRJ-201ENST00000418331 USH1CQ9Y6N9 552 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRJ-201ENST00000418331 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.83■■□□□ 1.25
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PTPRJ-201ENST00000418331 RASA4O43374 803 aa22.8■■□□□ 1.24
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PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
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PTPRJ-201ENST00000418331 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PTPRJ-201ENST00000418331 GGPS1O95749 300 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRJ-201ENST00000418331 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC18A3Q16572 532 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRJ-201ENST00000418331 MAML1Q92585 1016 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRJ-201ENST00000418331 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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