RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GUA9 196 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 SFI1A8K8P3 1242 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 ITGB1P05556 798 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 GUCY2CP25092 1073 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 PEX3P56589 373 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 MAPK6Q16659 721 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 USP49Q70CQ1 688 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC43Q8N309 656 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CNNM3Q8NE01 707 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 DRC1Q96MC2 740 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC169A6NNP5 214 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 ACKR2O00590 384 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 LAG3P18627 525 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 LIG1P18858 919 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 PLCG1P19174 1290 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 EFNA5P52803 228 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 MAPK7Q13164 816 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC15Q8TF66 581 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 KCND2Q9NZV8 630 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 IPPQ9Y573 584 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 K7ERI5 159 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 F13A1P00488 732 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKCBP05771 671 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 ITGA4P13612 1032 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 DDIT3P35638 169 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 NPTX2P47972 431 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 PKP1Q13835 747 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 STK38Q15208 465 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 ARSHQ5FYA8 562 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF39Q9H2S5 420 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 USP20Q9Y2K6 914 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 ARID2Q68CP9 1835 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CAMK1Q14012 370 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 MCM6Q14566 821 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC27A1Q6PCB7 646 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 POF1BQ8WVV4 589 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 RAD54LQ92698 747 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 RSAD1Q9HA92 442 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 HES2Q9Y543 173 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 TRANK1O15050 2925 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 SPTLC2O15270 562 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 FGF18O76093 207 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 NPTXRO95502 500 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJB1P25685 340 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF558Q96NG5 402 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-204ENST00000416021 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PLS3P13797 630 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PBX3P40426 434 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 TIGD5Q53EQ6 642 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 GPBP1Q86WP2 473 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 URGCPQ8TCY9 931 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.26■■□□□ 1.31
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