RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF623O75123 536 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 DDHD2O94830 711 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 GALNT17Q6IS24 598 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 FLCNQ8NFG4 579 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 MBOAT7Q96N66 472 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 IRAK3Q9Y616 596 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 ERLIN2O94905 339 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 ALDH2P05091 517 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 AK2P54819 239 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 CYP4A11Q02928 519 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 PPP2R5CQ13362 524 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 NPY5RQ15761 445 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 NEK8Q86SG6 692 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 RNF149Q8NC42 400 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 LXNQ9BS40 222 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 VAV3Q9UKW4 847 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 USP34Q70CQ2 3546 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 NRP1O14786 923 aa21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 ITGA4P13612 1032 aa21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 RFC5P40937 340 aa21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 OR1G1P47890 313 aa21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 EMC2Q15006 297 aa21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 XKR9Q5GH70 373 aa21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 EXOC8Q8IYI6 725 aa21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 DYDC2Q96IM9 177 aa21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 APOL6Q9BWW8 343 aa21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 RGL1Q9NZL6 768 aa21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 USTQ9Y2C2 406 aa21.58■■□□□ 1.05
UBXN4-202ENST00000415164 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 CDKL5O76039 1030 aa21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 URODP06132 367 aa21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 XBP1P17861 261 aa21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 CLCN4P51793 760 aa21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 GPR149Q86SP6 731 aa21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 FAM20AQ96MK3 541 aa21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 FBXL21Q9UKT6 434 aa21.57■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 EPHA7Q15375 998 aa21.56■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 UBXN11Q5T124 520 aa21.56■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 POTEDQ86YR6 584 aa21.56■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 TPH2Q8IWU9 490 aa21.56■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 OXER1Q8TDS5 423 aa21.56■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 TCP11Q8WWU5 503 aa21.56■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 CPB2Q96IY4 423 aa21.56■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 MTRQ99707 1265 aa21.56■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.56■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.56■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 STK39Q9UEW8 545 aa21.56■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 NUBP1P53384 320 aa21.55■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 SCRN1Q12765 414 aa21.55■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.55■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 FERMT3Q86UX7 667 aa21.55■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 STK25O00506 426 aa21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB39O15060 712 aa21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 SOD2P04179 222 aa21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 MLH1P40692 756 aa21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 C4orf19Q8IY42 314 aa21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 HAS1Q92839 578 aa21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 GAD1Q99259 594 aa21.54■■□□□ 1.04
UBXN4-202ENST00000415164 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms