RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.47□□□□□ -0.89
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.47□□□□□ -0.89
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.47□□□□□ -0.89
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CSRNP2Q9H175 543 aa9.47□□□□□ -0.89
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FZD8Q9H461 694 aa9.47□□□□□ -0.89
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CFAP45Q9UL16 551 aa9.47□□□□□ -0.89
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COG5Q9UP83 839 aa9.47□□□□□ -0.89
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.47□□□□□ -0.89
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1B0GUA9 196 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PP2D1A8MPX8 630 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 E9PMD0 336 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACKR2O00590 384 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LPXNO60711 386 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGEF15O94989 841 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 F13A1P00488 732 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00271P0C7V0 271 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLA2G4BP0C869 781 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPM6BQ13491 265 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STK38Q15208 465 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ECM1Q16610 540 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AMHR2Q16671 573 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RINT1Q6NUQ1 792 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GIT1Q9Y2X7 761 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EPOPA6NHQ4 379 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPTLC2O15270 562 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HIP1RO75146 1068 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRKCBP05771 671 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLS3P13797 630 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FGFR4P22455 802 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDC25AP30304 524 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC12A3P55017 1021 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLCB3Q01970 1234 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRT17Q04695 432 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF558Q96NG5 402 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CASD1Q96PB1 797 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PNMA5Q96PV4 448 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP28Q96RU2 1077 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRC27Q9C0I9 530 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CUEDC2Q9H467 287 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CERS4Q9HA82 394 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RSAD1Q9HA92 442 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAGEF1Q9HAY2 307 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPRC5CQ9NQ84 441 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 THEGQ9P2T0 379 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLIC4Q9Y696 253 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYO7AQ13402 2215 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.45□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 K7ERI5 159 aa9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CUTAO60888 179 aa9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NR1I2O75469 434 aa9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GABBR2O75899 941 aa9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FGFR1P11362 822 aa9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITGA4P13612 1032 aa9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLCG1P19174 1290 aa9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPTX2P47972 431 aa9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF131P52739 623 aa9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBXN11Q5T124 520 aa9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNK18Q7Z418 384 aa9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.44□□□□□ -0.9
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms