RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 GBP3Q9H0R5 595 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 RNF39Q9H2S5 420 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 COG5Q9UP83 839 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 IPPQ9Y573 584 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 HIP1RO75146 1068 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.812e-7■■■□□ 14.9
PTPRN2-204ENST00000404321 BMP15O95972 392 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 AXLP30530 894 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 23.2
PTPRN2-204ENST00000404321 NAMPTP43490 491 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 KIFAP3Q92845 792 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 IFT74Q96LB3 600 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 CSRNP2Q9H175 543 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 IGFLR1Q9H665 355 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 RSAD1Q9HA92 442 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRN2-204ENST00000404321 NPTXRO95502 500 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 ITGA4P13612 1032 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 KCNA5P22460 613 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 UBA7P41226 1012 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PPP2R5AQ15172 486 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 HYIQ5T013 277 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 FZD8Q9H461 694 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC169A6NNP5 214 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 POMCP01189 267 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PRKCBP05771 671 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PEX3P56589 373 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 BCAR1P56945 870 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 HYAL1Q12794 435 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PTPAQ15257 358 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 MAPK6Q16659 721 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 SPECC1Q5M775 1068 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 DAW1Q8N136 415 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC51Q96ER9 411 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 AK8Q96MA6 479 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 SPG21Q9NZD8 308 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 MYO7AQ13402 2215 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 A0A1B0GUA9 196 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 SFI1A8K8P3 1242 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 B4GALT3O60512 393 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 EDN1P05305 212 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PLA2G4BP0C869 781 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 AKAP5P24588 427 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 ERVFC1P60507 584 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 AAK1Q2M2I8 961 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 URGCPQ8TCY9 931 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 LRRC15Q8TF66 581 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 TLR9Q9NR96 1032 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 CLDND1Q9NY35 253 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PPM1AP35813 382 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms