RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-202ENST00000400053 OPTNQ96CV9 577 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF577Q9BSK1 485 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-202ENST00000400053 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-202ENST00000400053 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
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PTPRM-202ENST00000400053 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
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PTPRM-202ENST00000400053 H3BRJ5 948 aa9.42□□□□□ -0.9
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PTPRM-202ENST00000400053 OCM2P0CE71 109 aa9.42□□□□□ -0.9
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