RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 CUTAO60888 179 aa30.09■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 LTBRP36941 435 aa30.09■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 KRT85P78386 507 aa30.09■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
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GNPTAB-202ENST00000392919 ECHDC2Q86YB7 292 aa30.09■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 ASAP3Q8TDY4 903 aa30.09■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 POF1BQ8WVV4 589 aa30.09■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 NLRP4Q96MN2 994 aa30.09■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa30.09■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa30.09■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
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GNPTAB-202ENST00000392919 SLC12A3P55017 1021 aa30.08■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 RINT1Q6NUQ1 792 aa30.08■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
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GNPTAB-202ENST00000392919 RUSC1Q9BVN2 902 aa30.08■■■□□ 2.41
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GNPTAB-202ENST00000392919 CWH43Q9H720 699 aa30.08■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 IFT122Q9HBG6 1241 aa30.08■■■□□ 2.41
GNPTAB-202ENST00000392919 CD320Q9NPF0 282 aa30.08■■■□□ 2.41
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GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa30.08■■■□□ 2.41
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GNPTAB-202ENST00000392919 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC55Q6ZSA7 311 aa30.07■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 C1orf186Q6ZWK4 172 aa30.07■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa30.07■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 RNF169Q8NCN4 708 aa30.07■■■□□ 2.4
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GNPTAB-202ENST00000392919 ME1P48163 572 aa30.06■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 CTC1Q2NKJ3 1217 aa30.06■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 SHC4Q6S5L8 630 aa30.06■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa30.06■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM117Q9H0C3 514 aa30.06■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 POLD4Q9HCU8 107 aa30.06■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa30.06■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 GRXCR2A6NFK2 248 aa30.05■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.4
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GNPTAB-202ENST00000392919 CAPSQ13938 189 aa30.05■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 CLLU1OSQ5K130 101 aa30.05■■■□□ 2.4
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GNPTAB-202ENST00000392919 RAD54LQ92698 747 aa30.05■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC39Q9UFE4 941 aa30.05■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A087X0B3 334 aa30.04■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A0U1RQF3 1178 aa30.04■■■□□ 2.4
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GNPTAB-202ENST00000392919 AAASQ9NRG9 546 aa30.04■■■□□ 2.4
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GNPTAB-202ENST00000392919 MCM6Q14566 821 aa30.03■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 RRAGBQ5VZM2 374 aa30.03■■■□□ 2.4
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GNPTAB-202ENST00000392919 DAW1Q8N136 415 aa30.03■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 MINDY3Q9H8M7 445 aa30.03■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 TBX10O75333 385 aa30.02■■■□□ 2.4
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GNPTAB-202ENST00000392919 PBX3P40426 434 aa30.02■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 PTENP60484 403 aa30.02■■■□□ 2.4
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GNPTAB-202ENST00000392919 TFDP1Q14186 410 aa30.02■■■□□ 2.4
GNPTAB-202ENST00000392919 CLUL1Q15846 466 aa30.02■■■□□ 2.4
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GNPTAB-202ENST00000392919 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
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GNPTAB-202ENST00000392919 KIFAP3Q92845 792 aa30.02■■■□□ 2.4
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GNPTAB-202ENST00000392919 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
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GNPTAB-202ENST00000392919 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
GNPTAB-202ENST00000392919 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
GNPTAB-202ENST00000392919 EPHX3Q9H6B9 360 aa30.01■■■□□ 2.39
GNPTAB-202ENST00000392919 STK17AQ9UEE5 414 aa30.01■■■□□ 2.39
GNPTAB-202ENST00000392919 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
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