RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384310.1

RNU6-339P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 339, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-339P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-339P-201ENST00000384310 NAXEQ8NCW5 288 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 TTLL11Q8NHH1 800 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 CALML6Q8TD86 181 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 NETO1Q8TDF5 533 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 CLEC4DQ8WXI8 215 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 SLC35A4Q96G79 324 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 PPM1MQ96MI6 270 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 PTPN18Q99952 460 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 CNNM1Q9NRU3 951 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 UCKL1Q9NWZ5 548 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 NRBP1Q9UHY1 535 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 DENND2AQ9ULE3 1009 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 PALD1Q9ULE6 856 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 NRP2O60462 931 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 OPHN1O60890 802 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 FGF18O76093 207 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 ARHGEF15O94989 841 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 IL18RAPO95256 599 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 MSL3P1P0C860 447 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 KITP10721 976 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 SMARCA1P28370 1054 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 HSPA7P48741 367 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 GPR15P49685 360 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 HK3P52790 923 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 NRG3P56975 720 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 MVKQ03426 396 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 MGAT2Q10469 447 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 GRM1Q13255 1194 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 PRKG1Q13976 671 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 KCTD2Q14681 263 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 NOMO1Q15155 1222 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 TAF12Q16514 161 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 ZNF280DQ6N043 979 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 GGT6Q6P531 493 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 GAREM2Q75VX8 874 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 TMC6Q7Z403 805 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 MILR1Q7Z6M3 343 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 GLB1L2Q8IW92 636 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 NETO2Q8NC67 525 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 C3orf20Q8ND61 904 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 IL17REQ8NFR9 667 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 IL31RAQ8NI17 732 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 GAB3Q8WWW8 586 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 BRI3BPQ8WY22 251 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 TBC1D20Q96BZ9 403 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 ASIC4Q96FT7 647 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 FAM167AQ96KS9 214 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 NEUROD6Q96NK8 337 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 PPP1R16BQ96T49 567 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 JADE2Q9NQC1 790 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 BTBD7Q9P203 1132 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 SCOCQ9UIL1 159 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 SNX11Q9Y5W9 270 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 FFAR2O15552 330 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 SGSM2O43147 1006 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 GLI4P10075 376 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 FAHP16930 419 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 PRKCAP17252 672 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 PTGS1P23219 599 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 PPP3CAQ08209 521 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 IKZF1Q13422 519 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 PLS1Q14651 629 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 CNGA2Q16280 664 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 MPEG1Q2M385 716 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 SLC35G1Q2M3R5 365 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 CCDC178Q5BJE1 867 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 DACT2Q5SW24 774 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 RNF43Q68DV7 783 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 SH2D3CQ8N5H7 860 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 ANKS4BQ8N8V4 417 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 CCDC89Q8N998 374 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 ARRDC4Q8NCT1 418 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 LINC01599Q8WXQ3 324 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-339P-201ENST00000384310 ANKS1AQ92625 1134 aa4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms