RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 DMAC2Q9NW81 257 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 BCS1LQ9Y276 419 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 UBE4BO95155 1302 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 KRT13P13646 458 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF131P52739 623 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 XRCC4Q13426 336 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 K7ENM7 598 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 FLT3P36888 993 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 BFSP1Q12934 665 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 GPR88Q9GZN0 384 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 THAP2Q9H0W7 228 aa14.23□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 MGRN1O60291 552 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 BIRC2Q13490 618 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ODF2Q5BJF6 829 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 AKT1S1Q96B36 256 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 HVCN1Q96D96 273 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 KCND2Q9NZV8 630 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 NCANO14594 1321 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 KIF3CO14782 793 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ATP6V1G2O95670 118 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 MUTP22033 750 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 STYK1Q6J9G0 422 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 NOD2Q9HC29 1040 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SLX4Q8IY92 1834 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 PPIP5K2O43314 1243 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 COPB2P35606 906 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 DLG4P78352 724 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 MTMR3Q13615 1198 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 PADI6Q6TGC4 694 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 LDHDQ86WU2 507 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 PALB2Q86YC2 1186 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 RNF217Q8TC41 542 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 NR2E1Q9Y466 385 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 EMSYQ7Z589 1322 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 APBA3O96018 575 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 BCRP11274 1271 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 PPATQ06203 517 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 CETN1Q12798 172 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 RAPGEF5Q92565 580 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 AGPAT1Q99943 283 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.21□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 88.5
TMOD1-202ENST00000375175 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD62A6NC57 917 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 YDJCA8MPS7 323 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 TISP43B9A030 160 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 H0YGN5 161 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 GCKP35557 465 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 INHBEP58166 350 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF844Q08AG5 666 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 MYO1EQ12965 1108 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 GRIK3Q13003 919 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 DAW1Q8N136 415 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 C3orf20Q8ND61 904 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 CCT6BQ92526 530 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-202ENST00000375175 SYT11Q9BT88 431 aa14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms