RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 FTLP02792 175 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 CYP3A4P08684 503 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 CNTN2Q02246 1040 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 SEZ6Q53EL9 994 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 EFCAB12Q6NXP0 572 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 RSAD2Q8WXG1 361 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 ATP2C2O75185 946 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 HERVK_113P62684 666 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF667Q5HYK9 610 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC91Q7Z6B0 441 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 NUP85Q9BW27 656 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 IFNB1P01574 187 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 KRT1P04264 644 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 GNA15P30679 374 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 PPFIA1Q13136 1202 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 AGPAT1Q99943 283 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 PI4K2AQ9BTU6 479 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 FAM204AQ9H8W3 233 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 PDE11AQ9HCR9 933 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 RSPH14Q9UHP6 348 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 TBC1D8O95759 1140 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 CYP2C8P10632 490 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 DYNLT1P63172 113 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 OSBPL9Q96SU4 736 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 PLCB1Q9NQ66 1216 aa10.78□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 RFC5P40937 340 aa10.77□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 GPC5P78333 572 aa10.77□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 RFX6Q8HWS3 928 aa10.77□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 RDM1Q8NG50 284 aa10.77□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 IL31RAQ8NI17 732 aa10.77□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 ERGIC2Q96RQ1 377 aa10.77□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa10.77□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 PLIN4Q96Q06 1357 aa10.77□□□□□ -0.68
TTPAL-202ENST00000372904 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 CAPN9O14815 690 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 XPOTO43592 962 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 CYP3A7P24462 503 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 CENPPQ6IPU0 288 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 NRAPQ86VF7 1730 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 NAV1Q8NEY1 1877 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 OR6B2Q6IFH4 312 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 STK33Q9BYT3 514 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 ANAPC7Q9UJX3 599 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 NUB1Q9Y5A7 615 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 PDHXO00330 501 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 EVI5O60447 810 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 PON1P27169 355 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 NPTX2P47972 431 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 EFNA5P52803 228 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 TREML2Q5T2D2 321 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 DENND2CQ68D51 928 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 BTNL9Q6UXG8 535 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF720Q7Z2F6 126 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 OR6B3Q8NGW1 331 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 GRK7Q8WTQ7 553 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 CBWD1Q9BRT8 395 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 PIK3CDO00329 1044 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 KLRC4O43908 158 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 FGGP02679 453 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 APBA1Q02410 837 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 ERICH1Q86X53 443 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 OTUD6BQ8N6M0 293 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 C11orf70Q9BRQ4 267 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 ZWILCHQ9H900 591 aa10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 GAS8O95995 478 aa10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 SGO2Q562F6 1265 aa10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 REXO1L1PQ8IX06 675 aa10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 RHOT2Q8IXI1 618 aa10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 ABCB6Q9NP58 842 aa10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 MUTP22033 750 aa10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 CAPN12Q6ZSI9 719 aa10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 ADAM22Q9P0K1 906 aa10.76□□□□□ -0.69
TTPAL-202ENST00000372904 KCNJ6P48051 423 aa10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms