RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 RIPK2O43353 540 aa18.08■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 TPBGLP0DKB5 382 aa18.08■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 CNGA1P29973 690 aa18.08■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 ALDH3A1P30838 453 aa18.08■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 ADCY7P51828 1080 aa18.08■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 COASYQ13057 564 aa18.08■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 MAPK7Q13164 816 aa18.08■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 STK32AQ8WU08 396 aa18.08■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 ZFAND2BQ8WV99 257 aa18.08■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 RAD54LQ92698 747 aa18.08■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 TMEM109Q9BVC6 243 aa18.08■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 COA1Q9GZY4 146 aa18.08■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 KRT13P13646 458 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 UCHL3P15374 230 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 GM2AP17900 193 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 HSPA1LP34931 641 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 KCNH2Q12809 1159 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 LBRQ14739 615 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 ZFPM1Q8IX07 1006 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 CEP63Q96MT8 703 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 EPAS1Q99814 870 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 KLHL14Q9P2G3 628 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 A0A1B0GVG6 124 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 SP100P23497 879 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 KLC1Q07866 573 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 TCP10Q12799 353 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 FOXR2Q6PJQ5 311 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 ADGRF4Q8IZF3 695 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 PIGOQ8TEQ8 1089 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 BORCS6Q96GS4 357 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 NUDT12Q9BQG2 462 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 DBNDD1Q9H9R9 158 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 CYP39A1Q9NYL5 469 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 RGL1Q9NZL6 768 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 WDR35Q9P2L0 1181 aa18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 FAM170AA1A519 330 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 EDIL3O43854 480 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 RNF8O76064 485 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 RFC5P40937 340 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 RPL21P46778 160 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 PEX5P50542 639 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 LONRF1Q17RB8 773 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 RNF220Q5VTB9 566 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 CGB2Q6NT52 195 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 C18orf8Q96DM3 657 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 FAM210AQ96ND0 272 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 JMJD4Q9H9V9 463 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 RASAL2Q9UJF2 1139 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 H0Y3Z8 333 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 GNA14O95837 355 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 TTLL1O95922 423 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 GH1P01241 217 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 NOVP48745 357 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 ASPRV1Q53RT3 343 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 FAM26FQ5R3K3 315 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 VSTM1Q6UX27 236 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 TMEM237Q96Q45 408 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 NUDCD1Q96RS6 583 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 TRIM4Q9C037 500 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 NENFQ9UMX5 172 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 E7ENQ6 273 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 SHMT1P34896 483 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 MFSD5Q6N075 450 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 KCNK9Q9NPC2 374 aa18.06■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 FOXO6A8MYZ6 492 aa18.05■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 PPP2R5EQ16537 467 aa18.05■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 TXLNGQ9NUQ3 528 aa18.05■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 USP17L10C9JJH3 530 aa18.05■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP18.05■□□□□ 0.488e-15■■■■■ 44.8
GDE1-201ENST00000353258 DRG2P55039 364 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 MARSP56192 900 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 ZNF543Q08ER8 600 aa18.05■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 LONP2Q86WA8 852 aa18.05■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.05■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.05■□□□□ 0.48
GDE1-201ENST00000353258 CKAP2Q8WWK9 683 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms