RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.49■■□□□ 1.19
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KCNQ1-202ENST00000335475 RPS6KA5O75582 802 aa22.48■■□□□ 1.19
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KCNQ1-202ENST00000335475 CCND2P30279 289 aa22.48■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 MXI1P50539 228 aa22.48■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 ERVK-9P63128 1117 aa22.48■■□□□ 1.19
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KCNQ1-202ENST00000335475 C12orf42Q96LP6 360 aa22.48■■□□□ 1.19
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KCNQ1-202ENST00000335475 BSNDQ8WZ55 320 aa22.48■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 KAT5Q92993 513 aa22.48■■□□□ 1.19
KCNQ1-202ENST00000335475 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.48■■□□□ 1.19
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KCNQ1-202ENST00000335475 TBX20Q9UMR3 447 aa22.48■■□□□ 1.19
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KCNQ1-202ENST00000335475 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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KCNQ1-202ENST00000335475 WDR90Q96KV7 1748 aa22.47■■□□□ 1.19
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KCNQ1-202ENST00000335475 ITGA4P13612 1032 aa22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 DSG3P32926 999 aa22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 TCEAL1Q15170 157 aa22.45■■□□□ 1.18
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KCNQ1-202ENST00000335475 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.45■■□□□ 1.18
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KCNQ1-202ENST00000335475 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.45■■□□□ 1.18
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KCNQ1-202ENST00000335475 FZD9O00144 591 aa22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 HSF2BPO75031 334 aa22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SEMA4DQ92854 862 aa22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 WRNIP1Q96S55 665 aa22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC169A6NNP5 214 aa22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SART1O43290 800 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
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KCNQ1-202ENST00000335475 SOX10P56693 466 aa22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 TTMPQ5BVD1 217 aa22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SAAL1Q96ER3 474 aa22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 FBXL18Q96ME1 805 aa22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.44■■□□□ 1.18
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