RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SHROOM2Q13796 1616 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 PPM1NQ8N819 430 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 TTC13Q8NBP0 860 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 ASIC4Q96FT7 647 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 MTMR2Q13614 643 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 GPD1LQ8N335 351 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 TTC8Q8TAM2 541 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 ULK4Q96C45 1275 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 EGFL8Q99944 293 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 DONSONQ9NYP3 566 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 IP6K2Q9UHH9 426 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 GPS1Q13098 491 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 MORC4Q8TE76 937 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC151A5D8V7 595 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC188H7C350 402 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 ROR1Q01973 937 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 EFHC2Q5JST6 749 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 NDFIP2Q9NV92 336 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 STAP1Q9ULZ2 295 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 CTIFO43310 598 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 RAPGEF5Q92565 580 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 E2F6O75461 281 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 KRT38O76015 456 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM55Q9BYV6 548 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 CAPN11Q9UMQ6 739 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 ACAD11Q709F0 780 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 MXD3Q9BW11 206 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 TADA3O75528 432 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 HOXD10P28358 340 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 CEP19Q96LK0 163 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 EMSYQ7Z589 1322 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SYCP2LQ5T4T6 812 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 ACAP3Q96P50 834 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SUFUQ9UMX1 484 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 NCAPD2Q15021 1401 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 KRT39Q6A163 491 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SH3KBP1Q96B97 665 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SLC13A1Q9BZW2 595 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 PMS2P54278 862 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 KPNA7A9QM74 516 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 TRPC7Q9HCX4 862 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 GRIK1P39086 918 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 LDHDQ86WU2 507 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL11Q9NVR0 708 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 PDCLQ13371 301 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 TBCCQ15814 346 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP69A5D8W1 941 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 FOXN1O15353 648 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SMARCA1P28370 1054 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 ZBED8Q8IZ13 594 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf54Q8WWF1 131 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 KIF28PB7ZC32 967 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 ATICP31939 592 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 RNF149Q8NC42 400 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 PBXIP1Q96AQ6 731 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ESYT3A0FGR9 886 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SCOCQ9UIL1 159 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 KRT14P02533 472 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 GUCY2CP25092 1073 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL38Q2WGJ6 581 aa23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms