RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.23□□□□□ -0.61
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CLN8-201ENST00000331222 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
CLN8-201ENST00000331222 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa11.21□□□□□ -0.62
CLN8-201ENST00000331222 KCNN4O15554 427 aa11.21□□□□□ -0.62
CLN8-201ENST00000331222 NDUFA10O95299 355 aa11.21□□□□□ -0.62
CLN8-201ENST00000331222 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
CLN8-201ENST00000331222 VAMP7P51809 220 aa11.21□□□□□ -0.62
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CLN8-201ENST00000331222 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
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