RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM132AQ24JP5 1023 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKLE1Q8NAG6 615 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC113Q9H0I3 377 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAMTS10Q9H324 1103 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLIC2O15247 247 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR32O75388 356 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 NR3C1P04150 777 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 NR2F2P24468 414 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CREBRFQ8IUR6 639 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP63Q96MT8 703 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBTD1Q05BQ5 628 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARMCX5Q6P1M9 558 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 IKZF4Q9H2S9 585 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFIL3Q16649 462 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPAINQ86UA6 219 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 OSMRQ99650 979 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 FZD8Q9H461 694 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACKR2O00590 384 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERLIN2O94905 339 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 THPOP40225 353 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPAG1Q07617 926 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 EEF2KMTQ96G04 330 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRPV6Q9H1D0 765 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 MROH7Q68CQ1 1323 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 B4GALT4O60513 344 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNA14O95837 355 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGRP01833 764 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP2J2P51589 502 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYBPC2Q14324 1141 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDKAL1Q5VV42 579 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLFN12LQ6IEE8 588 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZPBP2Q6X784 338 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRIMPOLQ96LW4 560 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSD3B7Q9H2F3 369 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 MINDY3Q9H8M7 445 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRPV2Q9Y5S1 764 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD63C9JTQ0 380 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF18P17022 549 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDK7P50613 346 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM187BQ17R55 369 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP135Q66GS9 1140 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC55Q6ZSA7 311 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 C12orf56Q8IXR9 622 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 POMGNT1Q8WZA1 660 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTAGE1Q96RT6 745 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDY2AQ9Y6F7 541 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNJ18B7U540 433 aa30.01■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 TLR3O15455 904 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINC1P01008 464 aa30.01■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 DARSP14868 501 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNJ12Q14500 433 aa30.01■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP30.01■■■□□ 2.397e-11■■■■■ 49.4
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC9A9Q8IVB4 645 aa30.01■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDHR5Q9HBB8 845 aa30.01■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 TISP43B9A030 160 aa30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOC3O60645 756 aa30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAND2O75155 1236 aa30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTSHP09668 335 aa30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP1A3P13637 1013 aa30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 GARTP22102 1010 aa30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CATSPER4Q7RTX7 472 aa30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCHPQ9BT92 498 aa30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCIF1Q9H4Z3 704 aa30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPM2P07951 284 aa29.99■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPB41P11171 864 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNX17Q15036 470 aa29.99■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCP11X2Q5H9J9 407 aa29.99■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa29.99■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC155Q8N6L0 562 aa29.99■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 WNT8BQ93098 351 aa29.99■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CBWD1Q9BRT8 395 aa29.99■■■□□ 2.39
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