RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM109Q9BVC6 243 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTNNA2P26232 953 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP2J2P51589 502 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MESDQ14696 234 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLFN12Q8IYM2 578 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCHCR1Q8TD31 782 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNK9Q9NPC2 374 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 NHSQ6T4R5 1651 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 NRAPQ86VF7 1730 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 SBF2Q86WG5 1849 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZBTB39O15060 712 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 FTLP02792 175 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADCY1Q08828 1119 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MPP2Q14168 576 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 VSTM1Q6UX27 236 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 RDH13Q8NBN7 331 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 RMDN2Q96LZ7 410 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 PODXLO00592 558 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 COMTP21964 271 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 BTBD6Q96KE9 485 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZSWIM1Q9BR11 485 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.434e-6■■■□□ 18.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM86B1E9PN63 330 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGAP4P98171 946 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ART4Q93070 314 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 SUN1O94901 812 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP3A7P24462 503 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 GABPAQ06546 454 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLMAPQ14BN4 828 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 APEX2Q9UBZ4 518 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MEIS2O14770 477 aa23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 COILP38432 576 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 PEX5P50542 639 aa23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYCT1Q8N699 235 aa23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERMNQ8TAM6 284 aa23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 AGPAT1Q99943 283 aa23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALAS1P13196 640 aa23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MSH2P43246 934 aa23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 LENG9Q96B70 501 aa23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 52.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 EML1O00423 815 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCND1P24385 295 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPSM2P81274 684 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNIP1Q15025 636 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MFSD5Q6N075 450 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNV2Q8TDN2 545 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MBOAT7Q96N66 472 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGEF3Q9NR81 526 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 AAASQ9NRG9 546 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADAM22Q9P0K1 906 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 PARP2Q9UGN5 583 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF131P52739 623 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MGAT5Q09328 741 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPATA21Q7Z572 469 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 NARFQ9UHQ1 456 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 TP73O15350 636 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHKAP35790 457 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDE6BP35913 854 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 GCKP35557 465 aa23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms