RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 CATSPER3Q86XQ3 398 aa17■□□□□ 0.31
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CTSW-201ENST00000307886 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa17■□□□□ 0.31
CTSW-201ENST00000307886 TSPAN1O60635 241 aa16.99■□□□□ 0.31
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CTSW-201ENST00000307886 SLC11A1P49279 550 aa16.99■□□□□ 0.31
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CTSW-201ENST00000307886 C8orf76Q96K31 380 aa16.99■□□□□ 0.31
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CTSW-201ENST00000307886 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
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CTSW-201ENST00000307886 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
CTSW-201ENST00000307886 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
CTSW-201ENST00000307886 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa16.95■□□□□ 0.3
CTSW-201ENST00000307886 ARL5CA6NH57 179 aa16.95■□□□□ 0.3
CTSW-201ENST00000307886 OR52Z1P0C646 297 aa16.95■□□□□ 0.3
CTSW-201ENST00000307886 ITGA4P13612 1032 aa16.95■□□□□ 0.3
CTSW-201ENST00000307886 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CTSW-201ENST00000307886 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.3
CTSW-201ENST00000307886 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CTSW-201ENST00000307886 DSC1Q08554 894 aa16.95■□□□□ 0.3
CTSW-201ENST00000307886 TFDP1Q14186 410 aa16.95■□□□□ 0.3
CTSW-201ENST00000307886 TTC38Q5R3I4 469 aa16.95■□□□□ 0.3
CTSW-201ENST00000307886 NOTUMQ6P988 496 aa16.95■□□□□ 0.3
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