RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000275036.11

HMGN3-201, Transcript of high mobility group nucleosomal binding domain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-201ENST00000275036 PDIA5Q14554 519 aa16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 AMHR2Q16671 573 aa16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 RILPL1Q5EBL4 403 aa16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 PLPP4Q5VZY2 271 aa16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 AGMOQ6ZNB7 445 aa16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 GJD3Q8N144 294 aa16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 LZTS1Q9Y250 596 aa16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa16.02■□□□□ 0.16
HMGN3-201ENST00000275036 TRIP11Q15643 1979 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 MUTP22033 750 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 PRPHP41219 470 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 RAB27AP51159 221 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 BCAR1P56945 870 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 KCNC3Q14003 757 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 TFDP1Q14186 410 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 DUSP6Q16828 381 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 PADI6Q6TGC4 694 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 BSNDQ8WZ55 320 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 CPB2Q96IY4 423 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 TCF25Q9BQ70 676 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 TLE6Q9H808 572 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 POLD4Q9HCU8 107 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 DNAJB4Q9UDY4 337 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 CD207Q9UJ71 328 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.01■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 TRIOO75962 3097 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 ARHGEF35A5YM69 484 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 C19orf67A6NJJ6 358 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 LAD1O00515 517 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 B4GALT5O43286 388 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 ERLIN2O94905 339 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 EYA4O95677 639 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 SKIP12755 728 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 CYP11B2P19099 503 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 PPM1AP35813 382 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 COASYQ13057 564 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 ZNF280BQ86YH2 543 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 SMRP1Q8NCR6 262 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 MCPH1Q8NEM0 835 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 VN1R3Q9BXE9 311 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 NFKBIZQ9BYH8 718 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 BHMT2Q9H2M3 363 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 SPG21Q9NZD8 308 aa16■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 LRRIQ4A6NIV6 560 aa15.99■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.154e-6■■□□□ 12.4
HMGN3-201ENST00000275036 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 NOMO2Q5JPE7 1267 aa15.99■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 DTHD1Q6ZMT9 781 aa15.99■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 KCNK18Q7Z418 384 aa15.99■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 ADHFE1Q8IWW8 467 aa15.99■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 PPP2R3CQ969Q6 453 aa15.99■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 RNF39Q9H2S5 420 aa15.99■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa15.99■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 FAM86C2PA6NEL3 165 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 E9PMD0 336 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 PI4K2BG5E9Z4 385 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 DDHD2O94830 711 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 NCLP19338 710 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 COL9A1P20849 921 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 AXLP30530 894 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 SLC11A1P49279 550 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 NOTUMQ6P988 496 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 GLB1LQ6UWU2 654 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 PGBD4Q96DM1 585 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 RAB34Q9BZG1 259 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 CSRNP2Q9H175 543 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 PRKAG3Q9UGI9 489 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 HES2Q9Y543 173 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 IPPQ9Y573 584 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.98■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 C2orf71A6NGG8 1288 aa15.97■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 EDN1P05305 212 aa15.97■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 GALTP07902 379 aa15.97■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 KRT17Q04695 432 aa15.97■□□□□ 0.15
HMGN3-201ENST00000275036 KRT79Q5XKE5 535 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms