RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262291.8

VMP1-201, Transcript of vacuole membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMP1, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1-201ENST00000262291 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 COPS5Q92905 334 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 EVI5O60447 810 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 USP8P40818 1118 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.056e-14■■■□□ 18.9
VMP1-201ENST00000262291 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 JAM2P57087 298 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 NFIL3Q16649 462 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 CDHR1Q96JP9 859 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 ACP6Q9NPH0 428 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 NFASCO94856 1347 aa14.75□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 PALMO75781 387 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 ZMYND10O75800 440 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 GGPS1O95749 300 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 C2orf54Q08AI8 447 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 DRP2Q13474 957 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 PCYT2Q99447 389 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 F8VZ95 297 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 MOGSQ13724 837 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 EMC2Q15006 297 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 RDM1Q8NG50 284 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 RABGGTAQ92696 567 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 IWS1Q96ST2 819 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 GPR88Q9GZN0 384 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.74□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.053e-8■■■□□ 15.8
VMP1-201ENST00000262291 CALCAP01258 141 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 DNERQ8NFT8 737 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 MS4A14Q96JA4 679 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 PORCNQ9H237 461 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 OATP04181 439 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 STAT1P42224 750 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 SEZ6Q53EL9 994 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 XKR3Q5GH77 459 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 PALB2Q86YC2 1186 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 TRIM58Q8NG06 486 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 LMO3Q8TAP4 145 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 FGD4Q96M96 766 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 NOX5Q96PH1 765 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 NAGPAQ9UK23 515 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 MCM3APO60318 1980 aa14.73□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 H3BQF6 201 aa14.72□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 DGAT1O75907 488 aa14.72□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 SOX5P35711 763 aa14.72□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 PSEN1P49768 467 aa14.72□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 PPP2R5AQ15172 486 aa14.72□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.72□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.72□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 KIFAP3Q92845 792 aa14.72□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 SEMA4DQ92854 862 aa14.72□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.72□□□□□ -0.05
VMP1-201ENST00000262291 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms