RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 NCAPD2Q15021 1401 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 E2F6O75461 281 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 NAALADL2Q58DX5 795 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 RABGAP1LQ5R372 815 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 STOX1Q6ZVD7 989 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 NLRP10Q86W26 655 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 KIAA0825Q8IV33 1275 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 CPDO75976 1380 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 KRT8P05787 483 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 TAC1P20366 129 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 SOX5P35711 763 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 HDAC4P56524 1084 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 COPS2P61201 443 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 EPHA10Q5JZY3 1008 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 TBC1D9BQ66K14 1250 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 NCLNQ969V3 563 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 NOD1Q9Y239 953 aa10.83□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 PMLP29590 882 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 EXT2Q93063 718 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 SH3GL2Q99962 352 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 SMARCA1P28370 1054 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 HIF1AQ16665 826 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 ANKARQ7Z5J8 1434 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 FAM149B1Q96BN6 582 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 ERP27Q96DN0 273 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 RAD51CO43502 376 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 ZNF18P17022 549 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 SERPINB4P48594 390 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP10.82□□□□□ -0.683e-6■■■□□ 15.8
TTL-201ENST00000233336 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 GIPC2Q8TF65 315 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 CEP170P1Q96L14 293 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 SNX25Q9H3E2 840 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 CYP26B1Q9NR63 512 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 PFASO15067 1338 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 GOLGA8RI6L899 631 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 M0QZ92 97 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 CHEK2O96017 543 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 SEMA3FQ13275 785 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 TRIM60Q495X7 471 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 SERPINB10P48595 397 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 SLC18A3Q16572 532 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 LONRF1Q17RB8 773 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 CEP55Q53EZ4 464 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 POTEB3A0JP26 581 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 POTEFA5A3E0 1075 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 POTECB2RU33 542 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 ABL1P00519 1130 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 APOA1P02647 267 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 SLC4A1P02730 911 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 POTEIP0CG38 1075 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 CARSP49589 748 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 RCAN1P53805 252 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 KCNB1Q14721 858 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 SYDE2Q5VT97 1194 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 POTEBQ6S5H4 581 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 POTEGQ6S5H5 508 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 HEY1Q9Y5J3 304 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 ARSEP51690 589 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 AP1B1Q10567 949 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 LARGE2Q8N3Y3 721 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 TMEM2Q9UHN6 1383 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 ZNF233A6NK53 670 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 SCTRP47872 440 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 CCDC17Q96LX7 622 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 VCPKMTQ9H867 229 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 UBN1Q9NPG3 1134 aa10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 XDHP47989 1333 aa10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 KPNA7A9QM74 516 aa10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 SERPINB13Q9UIV8 391 aa10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 TTC13Q8NBP0 860 aa10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 THAP11Q96EK4 314 aa10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 COQ7Q99807 217 aa10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 BRIP1Q9BX63 1249 aa10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 VPS11Q9H270 941 aa10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 SRGNP10124 158 aa10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 MED21Q13503 144 aa10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 STAT4Q14765 748 aa10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 NMT2O60551 498 aa10.81□□□□□ -0.68
TTL-201ENST00000233336 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms