RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W SUA5P32579 426 aa9.52□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W SFK1P35735 353 aa9.52□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W TCD2P36101 447 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W BNA4P38169 460 aa9.52□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W RRN10P38204 145 aa9.52□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W TIF11P38912 153 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W MMF1P40185 145 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YIL024CP40543 189 aa9.52□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W EAF1Q06337 982 aa9.52□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W YLR352WQ06479 807 aa9.52□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W EAF3Q12432 401 aa9.52□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W PCC1Q3E833 88 aa9.52□□□□□ -0.88
PRP4YPR178W SOD2P00447 233 aa9.51□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W YCR100CP25606 316 aa9.51□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W ECM15P35195 104 aa9.51□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W IKI1P38874 309 aa9.51□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W IBA57P47158 497 aa9.51□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W YGL159WP53110 370 aa9.51□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W YGR026WP53217 278 aa9.51□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W ERV25P54837 211 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W KIN28P06242 306 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W PRB1P09232 635 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W MTC4P38335 694 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data9.5□□□□□ -0.89not detected
PRP4YPR178W FAA3P39002 694 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W PHO23P50947 330 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W NRK1P53915 240 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W YEH1Q07804 573 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W SUL2Q12325 893 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W VMA9Q3E7B6 73 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W HOM2P13663 365 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W MCK1P21965 375 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W BOS1P25385 244 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W YEF1P32622 495 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W MNT3P40549 630 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W GTT1P40582 234 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W LSM8P47093 109 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W MCM22P47167 239 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data9.5□□□□□ -0.89not detected
PRP4YPR178W YMR279CQ03263 540 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W BNA7Q04066 261 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W NAT4Q04751 285 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W CYK3Q07533 885 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W YOR385WQ08909 290 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W RRI1Q12468 440 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W ISN1Q99312 450 aa9.5□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W FUS1P11710 512 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W HAP4P14064 554 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W CBS1P14066 229 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W YCL002CP25565 263 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W MKS1P34072 584 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W DOA1P36037 715 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W YKL162CP36052 402 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W MET30P39014 640 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W PGD1P40356 397 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W COG7P53195 279 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W VHT1P53241 593 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W FYV6P53913 173 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W CAC2Q04199 468 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W GRC3Q07845 632 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W RRP40Q08285 240 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa9.49□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W ADK1P07170 222 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W REV1P12689 985 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W APA2P22108 325 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W CWH43P25618 953 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W FUN19P28003 413 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W ERG24P32462 438 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W VAM7P32912 316 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W UIP5P36137 443 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W RPL10P41805 221 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W MRX5P47007 382 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W UBX6P47049 396 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W MOG1P47123 218 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W YJR120WP47157 116 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W TOS2P50078 622 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W VEL1P53058 206 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W SGF73P53165 657 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W CDH1P53197 566 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W PNG1Q02890 363 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W YDL177CQ12257 170 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W AHC1Q12433 566 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W HBN1Q96VH4 193 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W MSB2P32334 1306 aa9.48□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W PHO2P07269 559 aa9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W ZRC1P20107 442 aa9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W SEC22P22214 214 aa9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W CNE1P27825 502 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26 ms