RNA–Protein interactions for RNA: YOR259C

RPT4, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT4, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT4	YOR259C	ERD2	P18414	219 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	UTR1	P21373	530 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	EPT1	P22140	391 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	AGP1	P25376	633 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	AHC2	P25649	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	PRE4	P30657	266 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	SUR1	P33300	382 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	SKN1	P33336	771 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YHR122W	P38829	231 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	MSS4	P38994	779 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	RCY1	P39531	840 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	FAU1	P40099	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	MET28	P40573	187 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	AZF1	P41696	914 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	AIM25	P47140	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	EXG2	P52911	562 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	COS10	P52924	374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	ROG1	P53118	685 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	MPS2	P53159	387 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	NPY1	P53164	384 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	VBA1	Q04301	562 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	ELP6	Q04868	273 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	OPI10	Q08202	246 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	ATG41	Q12048	136 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	PCL9	Q12477	304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YOS9	Q99220	542 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	STT4	P37297	1900 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	NAM9	P27929	486 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	FUN26	P31381	517 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	KRE6	P32486	720 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	PDC2	P32896	925 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	MTC2	P34246	357 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YKL069W	P36088	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	TUL1	P36096	758 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	IML3	P38265	245 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	RTC2	P38279	296 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	TAE1	P38340	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	LAG1	P38703	411 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	NSG1	P38837	291 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	SWM2	P40342	146 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	CIN1	P40987	1014 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	MAL11	P53048	616 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	GPG1	P53130	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	CGR1	P53188	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YGR026W	P53217	278 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	MEP3	P53390	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	MNT4	P53745	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YNR061C	P53747	219 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	AQR1	P53943	586 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	MSC1	Q03104	513 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	ROT1	Q03691	256 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	OST6	Q03723	332 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	RRN11	Q04712	507 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	REP2	P03872	296 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	CDC9	P04819	755 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	KIN28	P06242	306 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	STE12	P13574	688 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	AAC3	P18238	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	HOP1	P20050	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	SRB6	P32570	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	GMH1	P36125	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	SRO77	P38163	1010 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	COS8	P38723	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	ALP1	P38971	573 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	AIM2	P39721	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	SNM1	P40993	198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	CAT5	P41735	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	IDS2	P46958	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	MTL1	P53214	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	MTQ1	P53944	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	RSM28	Q03430	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	CCE1	Q03702	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPT4	YOR259C	SSK1	Q07084	712 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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