RNA–Protein interactions for RNA: YHL024W

RIM4, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene RIM4, Length 2,142 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM4	YHL024W	VHC1	P38329	1120 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YHL049C	P38722	271 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YHR122W	P38829	231 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	FET3	P38993	636 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YEL075C	P39972	122 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YER189W	P40104	122 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YFL064C	P43540	174 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YFL015C	P43578	164 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	IRC18	P47056	224 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YGL138C	P53122	345 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	TIM13	P53299	105 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ROY1	Q04847	553 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	CRF1	Q04930	467 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	RSF1	Q05043	376 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	HRD1	Q08109	551 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	GRX6	Q12438	231 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	TPK1	P06244	397 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	GPI10	P30777	616 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	PTM1	P32857	523 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SKT5	P34226	696 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YKL162C	P36052	402 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YBR013C	P38215	129 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ERV15	P38312	142 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	RRT2	P38332	387 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YBR285W	P38354	144 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	BDH1	P39714	382 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ATF1	P40353	525 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YKE4	P40544	346 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SSU1	P41930	458 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	RMD8	P43620	662 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	TOS3	P43637	560 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	MNN5	P46982	586 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	CPR7	P47103	393 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SNN1	P48232	102 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	UBC12	P52491	188 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YGL159W	P53110	370 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YGR066C	P53242	292 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	NRK1	P53915	240 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	MRP51	Q02950	344 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SMA2	Q04658	369 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SEN15	Q04675	128 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	PEX30	Q06169	523 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	RAD34	Q06665	692 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	HRT3	Q12347	344 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YPR1	Q12458	312 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	BAR1	P12630	587 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SEC59	P20048	519 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	AFG1	P32317	509 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	PPZ2	P33329	710 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SSS1	P35179	80 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SOL2	P37262	315 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	HXT9	P40885	567 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	NSE4	P43124	402 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	PET130	P47065	347 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ALT2	P52892	507 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	HHO1	P53551	258 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YNL184C	P53876	108 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YSA1	Q01976	231 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YDR124W	Q04608	324 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	NAT4	Q04751	285 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	MFB1	Q04922	465 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SLD7	Q08457	257 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	MDM32	Q12171	622 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	PET20	Q99373	253 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SPO7	P18410	259 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SNF6	P18888	332 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ZRC1	P20107	442 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YCK1	P23291	538 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YCL049C	P25577	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ERG3	P32353	365 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
RIM4	YHL024W	FRE1	P32791	686 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	HIS2	P38635	335 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	VRG4	P40107	337 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	PRM10	P42946	383 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	BIO3	P50277	480 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	TAM41	P53230	385 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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