RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	CKB2	P38930	258 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	FAA3	P39002	694 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	NTA1	P40354	457 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	VMA21	P41806	77 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GDS1	P41913	522 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	IRC7	P43623	340 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	TAD2	P47058	250 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	TRM9	P49957	279 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	AVT4	P50944	713 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SKP1	P52286	194 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MDM34	P53083	459 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CYT2	Q00873	224 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CTF19	Q02732	369 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ARG7	Q04728	441 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ANT1	Q06497	328 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ATG10	Q07879	167 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SRL2	Q12020	392 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	TMA17	Q12513	150 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	TRK2	P28584	889 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PRE4	P30657	266 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	STE14	P32584	239 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SFC1	P33303	322 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SNC2	P33328	115 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	FRE2	P36033	711 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ALY1	P36117	915 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	VBA5	P36172	582 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	FAT1	P38225	669 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GPI16	P38875	610 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	HPA3	P39979	161 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	FET4	P40988	552 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PFD1	P46988	109 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	COS10	P52924	374 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	FLC3	P53121	802 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	TIM21	P53220	239 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YGR079W	P53249	370 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YPL067C	Q02754	198 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	VPS28	Q02767	242 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RIM13	Q03792	727 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YDR391C	Q04170	232 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CUR1	Q06469	252 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YLR036C	Q07986	203 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	FLO1	P32768	1537 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GSC2	P40989	1895 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	STE50	P25344	346 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YBR197C	P38306	217 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ATG12	P38316	186 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ALP1	P38971	573 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	HEM14	P40012	539 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	KHA1	P40309	873 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	BMT5	P40493	336 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CHA4	P43634	648 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	HXT16	P47185	567 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	AZR1	P50080	613 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PHB2	P50085	310 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	DIA1	P54005	336 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ROD1	Q02805	837 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CTF3	Q12748	733 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		3.38	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SUC2	P00724	532 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SWI5	P08153	709 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MSF1	P08425	469 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	NUP1	P20676	1076 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MAK31	P23059	88 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	VBA3	P25594	458 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ADE1	P27616	306 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MNS1	P32906	549 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PNT1	P38969	423 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YEL076C	P39971	216 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	HAT2	P39984	401 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GET2	P40056	285 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ELO3	P40319	345 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ARG2	P40360	574 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YFL040W	P43562	540 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CSN12	P47130	423 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GUP1	P53154	560 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PEX31	P53203	462 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YGR126W	P53274	230 aa		3.37	□□□□□ -1.87

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