RNA–Protein interactions for RNA: YBR118W

TEF2, Transcript of Translational elongation factor EF-1 alpha, yeast

Gene TEF2, Length 1,377 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TEF2	YBR118W	PTC6	P25646	442 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	RIB7	P33312	244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	SLC1	P33333	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	SEC66	P33754	206 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	CCZ1	P38273	704 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	RTC2	P38279	296 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	FAA3	P39002	694 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	YER184C	P39961	794 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	YNL195C	P40168	261 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	CFD1	P40558	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	HXT9	P40885	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	CIN1	P40987	1014 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	SAM37	P50110	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	PAU12	P53343	120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	NRM1	P53718	249 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	HXT11	P54862	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	RSM28	Q03430	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	COQ10	Q08058	207 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	HNT3	Q08702	217 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	MCP1	Q12106	302 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	SIR2	P06700	562 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	COX9	P07255	59 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	CAP2	P13517	287 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	ERD1	P16151	362 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	YPK2	P18961	677 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	DAL82	P21705	255 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	SPT14	P32363	452 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	EMP70	P32802	667 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	VPS17	P32913	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	MDL1	P33310	695 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	ZRT3	P34240	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	MAL32	P38158	584 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	SER2	P42941	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	RPE1	P46969	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	LCL3	P53153	274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	MAL12	P53341	584 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	RRN9	P53437	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	YNR062C	P53748	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	INP1	Q03694	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	DCR2	Q05924	578 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	GUP2	Q08929	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	RAD51	P25454	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	DOA4	P32571	926 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	YEF1	P32622	495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	SDS22	P36047	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
TEF2	YBR118W	SRL3	P36167	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	THI2	P38141	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	CHK1	P38147	527 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	PAU24	P38155	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	YHK8	P38776	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	SKN7	P38889	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	FET3	P38993	636 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	FMC1	P40491	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	POP1	P41812	875 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	LEM3	P42838	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	SPG5	P42933	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	PMT6	P42934	759 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	BNA6	P43619	295 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	PMT5	P52867	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	TPN1	P53099	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	PFA5	Q03289	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	EKI1	Q03764	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	GPN3	Q06543	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	NPC2	Q12408	173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF2	YBR118W	PDE2	P06776	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TEF2	YBR118W	CYT1	P07143	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TEF2	YBR118W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TEF2	YBR118W	STE12	P13574	688 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TEF2	YBR118W	GCN3	P14741	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TEF2	YBR118W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TEF2	YBR118W	YCL002C	P25565	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TEF2	YBR118W	HYM1	P32464	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 124.1 ms